Alguien ha robado la corona del rey Neptuno y Don Cangrejo es el principal sospechoso. A pesar de haber sido pasado por alto para una promoción por el Sr. Cangrejo, Bob Esponja y su fiel (pero tonto) amigo Patrick se ofrecen como voluntarios para hacer el peligroso viaje a Shell City para recuperar la corona y salvar la vida del Sr. Cangrejo. Juega como Bob Esponja o Patrick mientras interactúan con los personajes de la película, gana puntos de "virilidad" para ganar potenciadores y explora vastos entornos en el "Patty Wagon".
