En el mundo futurista de Nano Breaker, las nanomáquinas, que se desarrollaron originalmente para enriquecer a la humanidad, de repente fallaron. Las máquinas comenzaron a recolectar la sangre de los humanos y el hierro de los edificios en un esfuerzo por construir un ejército de máquinas monstruosas. Para combatir esta amenaza, debes abrirte camino a través de hordas de unidades enemigas para salvar al mundo del apocalipsis. Equipado con una poderosa Plasma Blade que cambia de forma, asumes el papel del héroe solitario, que debe defender a la humanidad de las nanomáquinas mortales.
